Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01680 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01680 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01680 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01680 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01680 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01680 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01680 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01680 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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