Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01648 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01648 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01648 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01648 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01648 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01648 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01648 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01648 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01648 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01648 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01648 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01648 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01648 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01648 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms