Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mtatp6P00848 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Mtatp6P00848 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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