Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apaf1O88879 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms