Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spsb2O88838 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb2O88838 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms