Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tom1O88746 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tom1O88746 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tom1O88746 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms