Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hcn2O88703 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hcn2O88703 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms