Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RradO88667 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RradO88667 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RradO88667 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RradO88667 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RradO88667 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RradO88667 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms