Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cops3O88543 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops3O88543 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms