Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3bO88509 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3bO88509 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms