Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme6O88425 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nme6O88425 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme6O88425 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms