Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nid2O88322 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nid2O88322 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nid2O88322 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nid2O88322 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nid2O88322 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nid2O88322 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nid2O88322 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms