Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfdp1O88271 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cfdp1O88271 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfdp1O88271 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms