Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd46O88174 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd46O88174 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms