Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtssO70370 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtssO70370 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtssO70370 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtssO70370 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtssO70370 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtssO70370 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtssO70370 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtssO70370 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms