Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgceO70258 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgceO70258 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgceO70258 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgceO70258 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgceO70258 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgceO70258 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgceO70258 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgceO70258 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgceO70258 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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