Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif6O55135 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif6O55135 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif6O55135 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Eif6O55135 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif6O55135 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif6O55135 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif6O55135 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif6O55135 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif6O55135 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif6O55135 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms