Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nipsnap1O55125 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms