Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copb2O55029 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copb2O55029 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms