Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1bO55017 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1bO55017 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms