Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc3O55013 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3O55013 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms