Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf13O54965 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf13O54965 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms