Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Socs5O54928 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Socs5O54928 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms