Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TsksO54887 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TsksO54887 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TsksO54887 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TsksO54887 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TsksO54887 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TsksO54887 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TsksO54887 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TsksO54887 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TsksO54887 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TsksO54887 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TsksO54887 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TsksO54887 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TsksO54887 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TsksO54887 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TsksO54887 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms