Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zmat3O54836 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms