Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csnk2a2O54833 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms