Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1baO35930 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1baO35930 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms