Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms