Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsm2O35900 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm2O35900 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms