Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sp100O35892 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sp100O35892 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sp100O35892 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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