Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfibp2O35711 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms