Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NudcO35685 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NudcO35685 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NudcO35685 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NudcO35685 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NudcO35685 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NudcO35685 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NudcO35685 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NudcO35685 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NudcO35685 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NudcO35685 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NudcO35685 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NudcO35685 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NudcO35685 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NudcO35685 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NudcO35685 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NudcO35685 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms