Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stag2O35638 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stag2O35638 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms