Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf6bO35451 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atf6bO35451 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atf6bO35451 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6bO35451 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atf6bO35451 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms