Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prrt1O35449 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Prrt1O35449 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prrt1O35449 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Prrt1O35449 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prrt1O35449 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prrt1O35449 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Prrt1O35449 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt1O35449 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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