Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ppt2O35448 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ppt2O35448 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms