Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn1O35350 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn1O35350 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn1O35350 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn1O35350 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms