Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d1bO35324 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh2d1bO35324 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms