Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe40O35185 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms