Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gfra3O35118 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms