Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scarb2O35114 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Scarb2O35114 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Scarb2O35114 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Scarb2O35114 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarb2O35114 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Scarb2O35114 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Scarb2O35114 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Scarb2O35114 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Scarb2O35114 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Scarb2O35114 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Scarb2O35114 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Scarb2O35114 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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