Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra2O08842 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra2O08842 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms