Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20878L7N244 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20878L7N244 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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