Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp955bL7N232 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms