Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IfnabL7MTU6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IfnabL7MTU6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms