Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm2056J3QQ02 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm2056J3QQ02 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms