Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8888J3QPX5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm8888J3QPX5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm8888J3QPX5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8888J3QPX5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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