Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gm5849J3QPE5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm5849J3QPE5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5849J3QPE5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5849J3QPE5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5849J3QPE5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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