Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8356J3QPD3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms