Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm21797J3QNW5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21797J3QNW5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm21797J3QNW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm21797J3QNW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm21797J3QNW5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21797J3QNW5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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